Постановление об издании республиканского журнала «Ватандаш» было принято Кабинетом Министров Республики Башкортостан 26 января 1996 года. В первый год вышло 3 номера издания. С 1997 года он стал ежемесячным.
«Ватандаш» – общественно-политический, научно-популярный и художественный журнал энциклопедического характера. Первым его редактором был Гайса Батыргареевич Хусаинов. Обращаясь к читателям самого 1-го номера, он писал, «цель издания – освещение жизни башкир во всей полноте. Наша задача – поднимать на его страницах проблемы истории, культуры, искусства, показать пути развития народа, его социально-экономическое положение, освещать воспросы духовного развития».
Многие известные журналисты, писатели и публицисты приняли участие в становлении и развитии журнала. Среди них были Миннигали Якупов, Рауф Насиров, Рашит Шакур, Ризван Хажиев, Маулит Ямалетдинов, Тансулпан Гарипова, Закир Зиннатуллин, Гузель Ситдикова, Рамиль Янбеков, Салимьян Бадретдинов, Минниса Багуманова, Зухра Алтынбаева и др. Каждый из них пришел в «Ватандаш» со своей идеей, кругом авторов и даже готовыми произведениями и способствовал формированию контента и стиля издания.
Главными редакторами в разные годы работали: Фарит Ахмадеев (2000-2012), Азамат Юлдашбаев (2012-2016), с 2017 года коллектив возглавляет кандидат филологических наук, заслуженный работник печати и средств массовой информации РБ, лауреат премии им. Ш. Худайбердина Рашида Рафкатовна Магадеева.
В настоящее время журнал представляет один из авторитетных изданий республики. Выходит на башкирском и русском языках. Отрадно отметить, что последние два года тираж «Ватандаш»а растет.
Хорошо представлен журнал в интернете: есть электронная версия, группы в социальных сетях. Каждый номер издания размещается в крупнейшем в России научном портале eLIBRARY.ru. Также эксклюзивные материалы журнала можно прочитать на платформе Яндекс.Дзен.
По итогам 2021 года журнал удостоен Знака Золотого фонда «Прессы России» 1-й степени.